MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_3

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017654	TTAAG	2	10	16	25	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017654	AAT	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017654	ACA	2	6	81	86	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017654	CT	3	6	115	120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017654	CCAA	2	8	233	240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017654	AACAT	2	10	252	261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017654	TTAAA	2	10	724	733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017654	AATC	2	8	746	753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017654	TA	3	6	759	764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017654	ATT	2	6	1664	1669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017654	ATT	2	6	1792	1797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017654	TAT	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017654	CAGG	2	8	2533	2540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017654	CAATC	2	10	5709	5718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017654	A	6	6	5760	5765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017654	CAC	2	6	5791	5796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017654	AACT	2	8	5847	5854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017654	AAC	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017654	GAA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017654	AGC	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017654	TGC	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017654	CTA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017654	CA	3	6	6222	6227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017654	TCT	2	6	7765	7770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017654	TCG	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017654	A	6	6	7814	7819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017654	CCA	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017654	GGT	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017654	CCA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017654	TC	3	6	7964	7969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017654	GAT	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017654	G	6	6	8076	8081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017654	GTG	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017654	CCA	2	6	8152	8157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017654	GCC	2	6	8202	8207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017654	G	6	6	8289	8294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017654	GCG	2	6	8317	8322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017654	T	6	6	8343	8348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017654	TGAG	2	8	8408	8415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017654	CGC	2	6	8427	8432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017654	G	6	6	8936	8941	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017654	TGT	2	6	10868	10873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017654	T	6	6	10892	10897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017654	TGGT	2	8	10905	10912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017654	TCAG	2	8	10935	10942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017654	GT	3	6	10994	10999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017654	TTG	2	6	11003	11008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017654	TCT	2	6	11078	11083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017654	A	7	7	11101	11107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017654	CTGG	2	8	11124	11131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017654	T	7	7	11329	11335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017654	T	6	6	11604	11609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017654	ATT	2	6	11635	11640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017654	TC	3	6	11643	11648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017654	ATT	2	6	11753	11758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017654	AAC	2	6	11772	11777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017654	AT	4	8	11787	11794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017654	AATGT	2	10	11812	11821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017654	T	6	6	11852	11857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017654	T	6	6	11906	11911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017654	GAC	2	6	11942	11947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017654	GCAAGA	2	12	11955	11966	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017654	TCAG	2	8	11984	11991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017654	ACG	2	6	11993	11998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017654	TTGA	2	8	12006	12013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017654	GAC	2	6	12027	12032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017654	TGA	2	6	12051	12056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.